景氣差連帶衝擊企業支付退休金的能力，財政部說，部分企業因營運困難，採取與員工協議分期給付退休金應急，協議分期支付的退休金，仍應視為一次給付，但員工可在累計超過免稅額年度再合併一次報稅。
舉例來說，老張在甲公司工作滿30年，將在98年3月退休，因全球金融風暴，公司與老張協議原本應一次給付的550萬元退休金，以分五期、每期110萬元方式分期支付，至99年2月全數付清。
經老張同意後，甲公司今年3月到12月陸續支付四期，共計440萬元退休金給老張；最後一期遲至99年2月再支付計110萬元。
財政部對於這類實為一次給付，但特殊狀況採取分期支付的退職所得，規定其免稅額仍應比照一次給付，以98年度為例，退職所得免稅額為16.9萬元，乘以退職服務年資以下者，全數免稅。
以老張之例，公司分期給付總額550萬元的退職所得，依財政部規定，其一次給付免稅額為507萬元（16.9萬元X30年）。依據雙方協議分期給付方式，老張98年總計拿到四期共440萬元，未超過免稅額507萬元，98年甲公司暫時不必開立扣繳憑單交老張報稅。
甲公司在99年2月付出最後一期110萬元退職所得給老張時，再合併98年累計已支付的440萬元，合計550萬元部分開立扣繳憑單。
財政部說，因為老張總計取得的退職所得550萬元，較一次給付的退職所得免稅額507萬元，超過43萬元，按照退職所得課稅規定，其中半數即21.5萬元，可合併在100年申報99年度個人綜所稅時再一併報稅。
財政部提醒企業，全球經濟不景氣導致公司業務萎縮或獲利衰退，原應一次給付的退職所得，受制財務或資金困難，經與員工達成協議採分期給付的退休金或資遣費，需注意扣繳稅款開立方式。
財部強調，這類退職所得仍屬一次領取的退職所得，當分期給付所得累計達一次給付定額免稅額時，應由扣繳義務人就超過定額免稅部分，在給付時依規定扣繳率扣取稅款，並在超過免稅額的給付年度，由受領人依累計領取總額繳稅。
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